《中国共产党机构编制工作条例》第二十条规定“各部门在履行职责过程中对职责划分规定在理解上有分歧的，应当主动协商解决。协商一致的意见，报本级机构编制委员会办公室备案审查。协商不一致的，应当提请本级机构编制委员会办公室按照有关规定进行协调。”实践中，大量职责分工争议是可以通过部门协商，采取明晰任务分工、完善工作流程、明确主次关系和各自职责权限等方式解决的，不必提请协调。

相关部门对职责分工争议，应首先采取主动协商的方式解决。已明确工作牵头部门的，以牵头部门为协商工作的主办部门；尚未明确工作牵头部门的，以首先对职责分工提出异议且建议共同协商的部门为协商工作的主办部门；其他相关部门是协商工作的协办部门。协商过程中，主办部门应当充分听取协办部门的意见，协办部门应当予以配合。经协商达成一致意见的，由主办部门将协商工作纪要报送本级编办备案审查，编办认为有必要发文明确的，按程序报批，并发文明确；认为没有必要发文的，予以备案。职责分工的协商是通过明晰任务分工、完善工作流程等方式解决职责分工争议问题，不能擅自改变法律法规、“三定”规定和党中央、国务院有关文件已经确定的职责分工。

相关部门协商未达成一致意见，由主办部门提请本级编办进行协调。编办受理申请后，组织争议各方开展协调，并在一定期限内提出协调意见。经反复协调难以达成一致意见时，编办根据改革与管理的实际需要，及时提出职责分工意见，按规定程序报批。经批准的职责分工意见，应当正式发文告知争议各方，争议各方必须严格执行。